Era filho do Tenente-coronel de Infantaria João Ayres Baptista, de Gáfete, e de Maria Magro, de Castelo de Vide; neto paterno de António Fernandes e de Maria Ayres, e materno de António Martins Magro e de Maria Gomes Ravasca, ambos desta vila. No processo em causa, do Santo Ofício, o Vigário da Matriz de Castelo de Vide é identificado com um nome um pouco diferente daquele que se pode ler, quer nos livros dos assentos paroquiais de Santa Maria da Devesa, quer no documento de resposta, por ele subscrito, ao questionário que deu origem ao "Diccionário Geográfico", obra em 44 volumes manuscritos, arquivada na Torre do Tombo, e que também é conhecida por "Memórias Paroquiais". Com efeito assinava sempre João Aires Baptista e não João Baptista Aires.